Ovviamente puoi usare la 1 su Net 2.0 ma non potrai usufruire delle novità inserite specifiche della nuova versione del framework. La 5 è comunque retrocompatibile al 100% quindi cambia pure il riferimento tranquillamente.

Ricorda che VS è un po' bastardo e a volte ti lascia il riferimento a quella vecchia anche se la cambi. Per essere sicuro, dalla finestra proprietà della DLL, imposta "Versione Specifica" su true, e a quel punto sei a posto.

Ciao