Come vedi dove visualizzi il precaricamento è un livello con position absolute, cioè calcola la posizione in base ai parametri

left: 400px;

top: 150px;

che sono le distanze dal bordo sinistro e dall'alto della pagina, quindi centrarlo significherebbe sempre tramita JavaScript verificare la risoluzione della finestra e calcolare una posizione centrate, ma la cosa non conviene molto.
PEr farlo scorrere mi pare basti sostituire Absolute con Relative in modo che le distaze siano relative e non assolute.
Comunque se vuoi puoi anche far apparire il tutto non in un livello basta che

<script type="text/javascript">
document.write('<div id="loading">[img]img/caricamento.gif[/img]</div>');
window.onload=function(){
document.getElementById("loading").style.display=" none";
}

</script>

Lo metti nel punto della pagina in cui vuoi farlo apparire eliminando tutta la PARTE CSS.
Se capisci la logica puoi tranquillamente giocarci in un casino di modi.

Ciao