E' javascript, non java. Ti rispondo, ma sei già segnalato per essere spostato nel forum appropriato, quindi evita di spammare anche di là:

se la finestra è stata aperta con javascript - via window.open(...), puoi chiuderla con window.close(); oppure self.close(); Puoi anche chiuderla da un'altra finestra, a patto che la finestra aperta abbia un nome, ossia, devi averla aperta con

codice:
var miafinestra = window.open("indirizzopagina.html", "miafinestra", "eventuali parametri");

// a questo punto è lecito
miafinestra.close();