devi modificare l'attributo "name" del checkbox aggiungendo alla fine del nome attuale due parentesi quadre. ad esempio, supponendo che al momento tu abbia un name="IDdati" dovrai cambiarlo in name="IDdati[]". Sarebbe consigliabile applicare il method $_POST anziché $_GET nel caso avessi molti dati da inviare.

per la query dovrai modificarla in questo modo:

codice:
DELETE FROM tabella WHERE id IN('$IDdati')
prima di eseguirla, per sfruttare la clausola IN, dovrai però implodere i vari dati recuperati dal form. Quindi, nella pagina che riceve questi dati, prima di lanciare la query aggiungerai:

Codice PHP:
$IDdati implode(','$_POST['IDdati']); 
in alternativa ci sarebbe la possibilità di ciclare con un foreach, ad esempio, l'array di dati recuperato dal checkbox del form. Ma la prima soluzione è molto più semplice...