Da questo stabilire se è un problema hardware del disco stesso, un virus o semplicemente un malfunzionamento è difficile.
Proviamo un passo alla volta.
La prima cosa che farei è quella di eliminare il file incriminato, in quale modo? Collegando entrambi gli hard disk e provando da modalita provvisoria e se continua a non funzionare da DOS.
Poi farei anche una scansione antivirus per togliere il problema "software".
Se la cosa persiste a quel punto mi preoccuperei di più pensando al hd che ci ha abbandonato