Prima di partire lo scandisk chiede se vuoi salterlo premendo un tasto qualsiasi
Poi una volta in win

Apri il registro di sistema (Start – Esegui – Regedit) e posizionati alla chiave:

HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\ Control\Session Manager

Sulla destra, all'interno di questa chiave, cerca e fai doppio click sulla multistringa denominata BootExecute. Di default questa stringa è impostata a autocheck autochk,tu la sostituisci con

autocheck autochk /k:X *

Dove al posto della X metti la lettera del tuo drive su cui non più lo Scandisk all’avvio.