Umhh c'è un pò di confusione...
se metti $cont=0 tutte le volte che entri poi $tot varra 1 per il fatto che hai fatto $tot=$cont+1 dove $cont=0... se ho capito bene cosa vuoi fare devi togliere $cont=0... o meglio dovresti rimettere il controllo
Codice PHP:
<?php
if(!isset($_COOKIE["utente"]))
{
  
$cont=0;
}
/*nota la posizione, forse prima sbagliavi qui*/
$tot=$cont+1;
$tot==$cont;
?>
E poi con $tot==$cont cosa volevi fare??? non lo riesco a capire...
Se volevi copiare il valore di $cont in $tot, bhe pensaci... che senso ha???
Avresti tutte le volte $cont=0 poi $tot=0+1 e poi $tot=0...