per iniziare metti un doctype. evita le formattazioni inline e dimenticati le tabelle per il layout. se fai un buon progetto non avrai problemi sui browser standard (opera, firefox, safari) ma forse ci sara' qualcosa da sistemare con IE (nelle varie versioni) usando i commenti condizionali.
per quanto riguarda l'intro, meglio se la levi. meno fai aspettare il visitoatre meglio è. meno click deve fare ancora meglio. in più, chi non ha flash installato non potrà entrare nel sito.
buon lavoro.