Col kernel standard di Ubuntu non credo ci sia bisogno, avendo tutto modulare...
Dai un'occhiata qui: http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=2780 .

Per rimanere sul semplice, se hai acpid e gli acpi-tools (o -utils, non ricordo di preciso) installati, puoi controllare la temperatura del processore (con un certo grado di imprecisione) col comando # acpi -V .