La cosa migliore è usare i programmi 3D. Il problema è che quelli "seri", costano molto ma, per cose semplici, come al solito, sono più che sufficienti anche i software free.

Da quanto ho appreso dal tuo messagio, vorresti poi utilizzare le tue creazioni in Flash. In questo caso credo che attualmente, non ci sia nulla in grado di eguagliare le potenzialità di programmi quali Lightwave, 3DS-MAX, Maya etc.., accoppiati a plug-in come Swift 3D che permette di "tradurre" le animazioni create, in sequenze comprensibili a Flash.