non uso il programma che hai tu, ma quando selezioni lo strumento gomma sicuramente compariranno delle opzioni: cerca e imposta in modo che il bordo sia sfumato, l'opacita' ridotta etc

ti ho fatto uno schizzo qua sotto di come farei io con gimp: a sinistra trovi le impostazioni dei livelli (al posto del rosso e del nero metterai le tue immagini) e a destra le impostazioni per la gomma (ovviamente fatte un po' a caso solo per farti l'esempio)



(clicca sulla miniatura qua sopra per ottenere l'immagine grande)