JBoss e' un application server ovvero un suite completa per applicazioni J2ee. Tra i vari moduli di Jboss vi è anche il servlet engine che per l'appunto e' Tomcat.
Quindi puoi vedere Tomcat come un modulo di Jboss: ma se devi solo far girare un sito con delle jsp Jboss ti e' solo d'impaccio in quanto molto piu' pesante: ti consiglio di continuare ad usare Tomcat da solo.

Apache e' un web server e ci vuole comunque sia con Tomcat che con JBoss.

ciao!!