Non stai lanciando l'applicativo correttamente!
Java è un interprete quindi devi caricare il classloader con le librerie. invece se ho capito bene tu clicchi direttamente su un file o qualcosa del genere.

Cerca. deve esserci un .so o un link eseguibile che imposta correttamente la stringa di lancio da shell

altrimenti se questo programma è composto di un unico file .jar puoi provare da shell

java -jar /dir_del_programma/programma.jar

se vedi degli errori prob è perchè non hai l'interprete java in path e allora devi trovare il programma java (generalmente bin/jdk.../ o opt/jdk...)

e lanciare bin/jdk.../java -jar /dir_del_programma/programma.jar