le applicazioni dovrebbe inserirtele nel menu. Se cosi non fosse bidogna aggiungerle. Per quanto riguarda l'installazione i programmi o si trovano pacchettizzati e si possono installare con colpi di click o con synaptic oppure si trovano i sorgenti che vanno compilati. Per quanto riguarda i file di un programma non funziona essattamente come win. Un programma installato viene suddiviso in varie directory in base ai file presenti. Per vedere i file installati di un programma installato da synapotic basta cercare il programma dopo tasto destro>proprietà>file installati. Per kguitar che ho installato anche io abbiamo vari file installati tra cui i manuali nella cartella doc, le librerie nella cartella lib e il vero eseguibile è contenuto in /usr/bin e si chiama kguitar, lanciandolo da terminale dovrebbe eseguirsi.
Come vedi è un po differente la cosa rispetto a win, si cerca di suddidere i file del programma in base alla loro natura.