Se usi Dreamweaver c'è un'extension che serve proprio a questo, mi pare si chiami "course builder" o qualcosa del genere. Prova a cercare sul sito della Macromedia (pardon... della Adobe), magari tra le extensions dedicate all'elearning.

Se non usi Dreamweaver (e non intendi farlo...) c'è un software opensource usato in elearning che si chiama "EXE", non lo conosco bene ma magari ti può aiutare.