significa che va a guarda nella cartella C:\php5\pear e nella cartella corrente (ecco il significato del "."). Vuol dire che se ti trovi ad avere la pagina index.php in

C:\wamp\www\appuntamenti\webapp\

e da questa fai un include/require:
codice:
require_once("percorso/cartella/file.inc.php");
apache vedrà la direttiva include e andrà a cercare, nell'ordine:

- al percorso corrente; e quindi cercherà di pescare il file
C:/wamp/www/appuntamenti/webapp/percorso/cartella/file.inc.php
-al percorso successivo (C:/php5/pear) e quindi il file
C:/php5/pear/percorso/cartella/file.inc.php
ora questo percorso non esiste e quindi amen, non succede niente. Controlla bene come hai messo i file e chi include cosa