Dopo aver letto la tua risposta mi sono documentato meglio, uso OpenWebMail e purtroppo da quello ceh ho letto, la versione ufficiale non usa maildir solo mbox, tempo fà per una versione vecchia una persona aveva realizzato una patch per poter scegliere quale dei due metodi di archiviazione postra usare.

Grazie dell'aiuto ora finalmente ho capito meglio come funziona il tutto e sò che non posso realizzare quello che volevo