Credo di aver capito dove è il problema.
I pdf non sono sul server web ma su un altro server locale con una cartella condivisa.
Quindi credo che iexplorer lo apra perchè è molto intergrato al SO, credo sia come aprire il file direttamente dalla cartella condivisa.
Ho fatto delle prove con i pdf caricati sul server web con link http:// ecc.. e si aprono anche su firefox.