non conosco fireworks, ma con inkscape puoi esportare l'immagine in png e mantiene la trasparenza

per il raster, devi badare che l'immagine sia su un livello e non come sfondo (di solito c'e' un'opzione), quindi puoi usare non solo il lazo, ma anche la bacchetta magica: imposta un po' di sfumatura e/o antialias in modo da "ammorbidire" i margini di rimozione nel caso siano curvi

se per esempio stai usando la bacchetta magica, li puoi selezionare uno a uno tenendo premuto shift o un qualche tasto analogo in modo da aggiungere una zona all'altra man mano che selezioni e quando hai completato la definizione delle aree che ti servono, le cancelli (modifica -> elimina o qualcosa di simile)

sono stata vaga sui percorsi non sapendo di quali programmi disponi, ma il metodo varia di poco da un programma all'altro