Allora ti dico subito che con IE7 si vede bene, quindi presumo si tratti di un problema eslusivo di IE6-.

Potresti postare uno screenshot?

Inoltre comincia a debuggare in modo selettivo in modo da circoscrivere il problema ad una determinata porzione di codice, così è più facile aiutarti o magari capisci tu da solo dove sta l'inghippo.

Ciao.