in alternativa
for ($i=0; $i<count($checked); $i++) {
//Supponendo che i valori del checkbox fossero gli ID della tabella
$query=mysql_query("DELETE FROM table WHERE id=$checked[$i]");
}
in alternativa
for ($i=0; $i<count($checked); $i++) {
//Supponendo che i valori del checkbox fossero gli ID della tabella
$query=mysql_query("DELETE FROM table WHERE id=$checked[$i]");
}