Ok. Allora te la metto in termini diversi. Ho reinstallato il template originale (quello sul quale ho fatto poi le modificazioni), e mi si visualizza correttamente sia su ie sia su firefox. Eppure c'è solo un css per entrambi. Evidentemente, durante la modificazione ho cambiato qualche impostazione che ora mi sfugge...
Ho ricontrollato tutti i file coinvolti .tpl e .css e persino .cfg. Nessuno ha subito modifiche così fondamentali o radicali: solo qualche cambio di colore o l'aggiunta di qualche tag per centrare o ridurre le celle (peraltro, ho ripristinato le vecchie misure e il problema è rimasto).
Insomma, non è un fattore di creare un nuovo foglio .css per ie, bensì capire qual è il problema e capire se è risolvibile senza creare un foglio apposito ogni volta che modifico un template.