(utilizzavo il compilatore borland) e ho sempre dovuto utilizzare i binari. A mio avviso, quando ci sono (e praticamente quasi sempre) ti conviene scaricarti i binari.
Non mi risulta che il compilatore Borland C++ 5.5 sia tra quelli utilizzabili per compilare MySQL in ambiente Windows.

Bisogna SEMPRE leggere la documentazione del progetto da compilare per scoprire quali sono i compilatori supportati, i requisiti da soddisfare e le modifiche da apportare per una compilare senza problemi.