codice:
<form action="registraquestionario.php" method="post">
  <input type="checkbox" name="risp[]" value="1" /> Blah blah

  <input type="checkbox" name="risp[]" value="2" /> Blah blah


...
  <input type="checkbox" name="risp[]" value="400" /> Blah blah

  <input type="submit" value="submit" />
</form>
A questo punto in registraquestionario.php avrai un array $_POST['risp'] che contiene tutte le risposte del questionario,

Codice PHP:
$risposte = serialize($_POST['risp']); //adesso è una stringa, la salvi in database 
Quando le devi tirar fuori
Codice PHP:
$risp = unserialize($row['risposte']); // $risp è un array