A prima vista non mi sembra che il client microsoft abbia opzioni relative al resuming di trasferimenti interrotti.
L'unica, in questo caso, mi pare sia per forza utilizzare un client differente.
Il server, inoltre, deve poterlo supportare, tale resuming, che impartirai tramite il comando "REST <marker>", dove "marker" è il numero di bytes da cui vuoi ricominciare il trasferimento, seguito da "RETR <nome_file>".