Ok ... non l'avevo vista perche' il codice non e' indentato (questa e' una conseguenza grave del codice scritto senza indentazione ... se un mio studente scrivesse una cosa del genere, neanche gli correggerei il compito ... ).

La condizione

A[i]!=B[j]

che hai inserito nella seconda for, non ti consentira' mai di passare alla if ...

E non mi sembra che basti ...