se il procedimento non deve essere automatico il metodo più veloce è la migrazione di dati di MySQL che puoi scaricare da http://www.mysql.com/products/tools/migration-toolkit/ se invece devi farlo in maniera automatica, da quello che so dirti di mysql, dovresti conservare i dati del database A nella macchina B per poi reinserirli con una query, e credimi, se la tabella è molto popolosa (>10000 righe) il procedimento può richiedere MOLTO tempo.