puoi mettere nella form

<form method="post">
<?php
include("conn.php");
$query0 = "SELECT id FROM utenti;";
$risultato0 = mysql_query($query0,$connessione) or die( "Errore: bla" . mysql_error() );

while($row=mysql_fetch_array($risultato0)) {
print "<input type='checkbox' name='utente$row[id]' id='utente$row[id]' value='1 ' />"
}
?>
</form>

Codice PHP:
<?php

include("conn.php");
$query0 "SELECT id FROM utenti;";
$risultato0 mysql_query($query0,$connessione) or die( "Errore: bla" mysql_error() );

while(
$row=mysql_fetch_array($risultato0)) {

echo (isset(
$_POST[$row[id]]) && $_POST[$row[id]] == "checkato" "non checkato");

}
?>