1. se carichi in un livello (e non in un movieClip) non puoi spostare il contenuto cosi facilmente. Puoi farlo ma devi usare l'as con ad esempio _level1._x = 100 e _level1._y = 100.
Appunto la soluzione più semplice sarebbe usare loadMovie ("file.swf", clipVuoto); creando un clip istanziato come "clipVuoto" cosi spostando quello vai a spostare anche il file che gli caricherai dentro.

2. probabilemnte fermi la musica con un stopAllSound e quindi è ovvio che tu non riesca sentire più nulla. Dovresti gestire la musica in maniera diversa, ad esmepio potresti usare:
mysound = new Sound(this);
mysound.attachSound("loop");
mysound.start(0, 100);
mysound.setVolume(80);

mettendo nella libreria il file audio assegnandogli "loop" come Concatenamento.

3. non ho capito l'effetto. ma in ogni caso al play del video puoi mettere delle maschere o delle forme nere con alpha 70% a coprire il sito.