parli di tabella temporanea ... ???
Se hai fatto una tabella temporanea questa viene eliminata con la chiusura della connessione. Se vuoi invece svuotare la tabella temporanea usa il truncate table, Se vuoi invece svuotare la cache dal risultato precedente: mysql_free_result($resource)
Comunque basta cambiare il nome della variabile che raccoglie il resource number della query per avere disponibili entrambi i risultati ben distinti.