Non so se esistando librerie già pronte, però il consiglio di mirko ti mette sulla giusta pista:

http://www.infoq.com/articles/cracki...2007-with-java

al di là del titolo roboante (non è nessun cracking di niente), l'articolo spiega bene come trattare un file in formato Word 2007: si scompatta e si tratta come un file XML.

non aveno Office 2007 (e nemmeno documenti di Word 2007), non posso provare il codice...