ricorda che il punto di riferimento che Flash utilizza per il percorso è la pagina HTML che lo incorpora, quindi un percorso "relativo".

Poniamo che tu abbia stabilito che il file .flv e il file .swf si trovino nella stessa cartella.
Quando fai "prova filmato" tutto funziona per il meglio.

Poniamo anche che sul sito tu abbia questa struttura:
> radice (dove per esempio ci sono le pagine HTML)
> sottocartella Flash (dove ha messo sia il file .swf che .flv)

apparentemente tutto OK

Ma se la pagina HTML (o php, asp, ecc.) che incorpora il file Flash (.swf) è posizionato nella radice, questi andrà a cerca il file .flv nella radice stessa!