io direi di disinstallare il vecchio pacchetto. Poi personalmente, nemmeno quando iniziai (oramai qualche anno fa) ho installato il trittico Apache+PHP+MySQL con uno di questi "pacchetti completi"... se non hai dati importanti da recuperare nel database, elimina tutto alla radice, e prova a fare l'installazione di apache, php e mysql separatamente. Di guide ce n'è a volontà (e pure di thread qui sul forum).
Poi tornando al tuo problema, se hai deciso che la memorizzazione su database possa essere una soluzione plausibile e sei a digiuno di interazione con database (ovviamente via php), ti consiglio sempre la guida
http://php.html.it/guide/