Premesso che ne so ben poco, se apri K3B hai una voce per formattare DVD.
Normalmente però quando scrivi un iso non è becessaria alcuna formattazione. Cancella quello che cìè e ci scrive sopra. E lo fa in automatico, previo consenso.

Comunque non fidarti molto di quanto ti ho detto. Io uso k3b solo per mettere le iso su un CD o un DVD. Mai fatto altro (o meglio tempo fa ho fatto dei CD di copia).