1)ho letto gli aiuti per Thunderbird sul sito ufficiale, si fa riferimento per alcune modifiche al file - USER.JS - che io non trovo sul mio pc è sotto altro nome?
Nella tua home directory prova sotto

./mozilla-thunderbird oppure ./thunderbird

e poi cerca la dentro ...

2)sul client vi sono diversi account di posta che in ricezione funzionano egreggiamente, per l'invio invece mi chiede la password del server SMTP (predefinito) in uscita che non ho mai avuto (e non coincide con quella per l'accesso )
In uscita per inviare devi usare il server SMTP del provider con il quale ti colleghi. Per esempio quando sono a casa io debbo usare il server di alice (out.alice.it) mentre quando sono al lavoro debbo usarne un altro perche' cambia il provider. Vedi qual'e' il tuo e configura di conseguenza l'account in uscita. Va detto che thunderbird consente di avere piu' account SMTP memorizzati ma ne puoi usare soltanto uno (in genere quello predefinito).