Nell'interpretazione della licenza, la chiave di tutto - per dirla in modo semplice semplice - sta nel fatto che sviluppando un sito web, tu scrivi codice php/sql, ma non stai *distribuendo* una parte di codice che appartiene alla MySQL AB
Discorso diverso per quelle applicazioni che devono essere rilasciate per forza di cose assieme a pezzi di codice della MySQL AB (il client, il server, entrambi, qualche libreria, ...).
Oltre a ciò ricordiamoci che utilizzare e modificare (per uso "interno", diciamo cosi) del codice sotto GPL non obbliga per forza di cose a rilasciare i sorgenti. Nel momento in cui rilasci un software che fa uso di codice sotto GPL, invece, devi fornire anche il tuo sorgente modificato, anch'esso sotto GPL o compatibile
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