ciao
fermo restando che puoi utilizzare il MYSQL facendo il dump del database (tutte le opzioni del dump le trovi sul manuale del MYSQL), io ti consilgio di scaricarti Mysqladmin (lo trovi sul sito ufficiale del Mysql) e con questo farti tutte le copie di backup che desideri dei database, scegliende le opzioni di inserire dati o meno.

E' molto semplice, io lo uso quando devi trasferire in remoto tutto il lavoro fatto in locale.

ciao
Ginko