Anch'io quoto il suggerimento di M4rco per non avere i colori in mezzo al PHP. Per una questione di efficienza però uso l'and logico, non il modulo:
Codice PHP:
for ($i = 0; $i < numero linee; ++$i) {
if ($i & 1) {
// Pari
...
} else {
// Dispari
...
}
}