Puoi mettere uno script all'esterno della cartella del tipo:

Codice PHP:

if ($handle opendir('dir')) {
   while (
false !== ($file readdir($handle))) {
      if (
$file != "." && $file != "..") {
         
unlink ($file);}
   }
};
closedir($handle);
rmdir('dir'); 
(ovviamente dovrebbe funzionare solo se nella dir ci sono solo file e non sottodir.)

CIAO!