le tabelle devono essere innoDB, nel menu struttura selezioni l'opzione "vedi relazioni" e ti viene proposto uno schema di selezione. Sempre che si parli di foreign key.

Se invece intendi relazioni tra tabelle ... phpmyadmin puo' fare alcune cose solo se imposti alcune opzioni... dovrebbe esserci una pillola al proposito, ma riferita ad una versione ormai sorpassata di phpmyadmin.