Aggiungo un'altra alternativa: personalmente scompatto i pacchetti pear e copio i file che mi servono in una directory locale interna al mio dominio (mettiamo "pear"). Poi imposto set_include_path('/pear'); nell'index.php e li uso.

Vantaggi: sei indipendente dal PEAR del provider, hai controllo assoluto sui packages e non hai bisogno di shell
Svantaggi: no installer automatico e devi conoscere bene quello di cui hai bisogno (comprese le sue dipendenze)