riferimentoSelect.selectedIndex=n;
dove n e' l' indice nell' array delle options dell' opzione che vuoi settare come selezionata

questo non setta selected="selected" per quell' option, fa si' che quell' option sia selezionata

per settare l' attributo selected
riferimentoOption.setAttribute('selected','selecte d');

se l' evento e' indotto via script nessun gestore evento scatta,
per es. se forzi il submit non scatta l' onsubmit