questo, per quanto mi sforzi di immaginarlo, non puo' essere possibile:
via ajax carichi un contenuto che entra a far parte del documento, con tutto quello che questo comporta

se il problema sono i fogli di stile, con regole aggiuntive sei in qualche modo in grado di aggirare le regole che valgono nel contenitore

per quanto riguarda questo
la pagina ha l'header, e con i classici metodi, ajax incluso, quando mostro il codice della pagina generata, mi riscrive l'header della pagina padre
mostri come? non e' detto debba essere il vero codice della pagina, sostituisci tutto quello che vuoi non compaia prima di mostrare il codice a video
se ti attendi modifiche in questa modalita' di visualizzazione prevedi un restore di quello che hai precedentemente cambiato