Ho risolto così...
Codice PHP:
Dim objFile2
objFile2 = Server.CreateObject("Scripting.FileSystemObject")
If objFile2.FolderExists(file2) Then
     objFile2.deleteFolder(file2, True)
End If 
Non pensavo esistesse direttamente la deleteFolder...
Il file2 deve essere un percorso senza la barra finale...esempio "c:\cartella"
Ciao.