Che io sappia puoi solo con uno scanner compatibile con i negativi, cioè che ha un apposito ingresso, come il mio ad esempio, l'Epson Perfection 2580Photo
.

Se il tuo non è così, prova a fare una regolare scansione, apri il file con Paint, vai su Immagine > Inverti colori, ma dubito che il risultato sarà buono.