Forse così è più chiaro:

<html>
<title>Titolo</title>

<head>

<script type="text/javascript">
<!--

function funzionejs(x)
{

for (i=0;i<x.length;i++){
alert(x[i]);
}
}

// -->
</script>


</head>
<body>

<?php
$temp =array("uno", "due");
echo "<form...>";

echo "<select name='c' onchange=\"funzionejs($temp)\"><option value='0'>genere</option>";
...

echo "</form>;
...

?>

</body>
</html>
Grazie