se la modifica di cui stiamo parlando la apporti via javascript non puo' interessare ajax,
semplicemente perche' non la esegue, semmai devi farla eseguire dopo aver ricevuto la risposta, come tutti gli script coinvolti nella risposta asincrona

ho appena provato con un contenuto dinamico caricato via ajax (xhtml1.1 entrambi i documenti):
se nel markup mi invento un attributo a firefox (allo stato attuale delle cose) non importa
se pero' per es. nel markup non annido i tag correttamente ho errori