Caro Andrea,
durante l'installazione ti verrà detto di interrompere i servizi che ne "danneggiano" il corretto proseguimento.

Le due piattaforme (ASP e ASP.NET) possono convivere tranquillamente, non ti preoccupare.

PS. Mail...??? Dove?? ehehehehehehe
Ormai non posso + stare senza le tue mail..