Devi farli caricare o in dei movieclip o su altri livelli, sia direttamente dal movie base che sui tasti, e devi dare ogni volta il percorso; sia al caricamento, che dai files esterni al base, se vuoi che i comandi dati nei files esterni e diretti al base funzionino.
Idem per i preload.
E' un po' dura spiegarti tutto qui, il meccanismo
L'ideale secondo me è che tu segua una guida base di flash per il caricamento di movies esterni con i vari sistemi.