Ti consiglio l'uso della buona vecchia glob().

Codice PHP:
$filename glob('versione *');
... 
Una volta che sai il nome del file puoi analizzare la stringa. Nel caso specifico farei:

Codice PHP:
list($major$minor$micro) = explode('.'substr($filename9)); 
Per qualcosa di più complesso puoi usare le espressioni regolari.